過敏性鼻炎是兒童最常見的慢性過敏性疾病，發生率逐年提升，罹患過敏性鼻炎的孩子反覆受到打噴嚏、鼻水、鼻塞的困擾，雖不是一種很嚴重的疾病，卻會影響孩子的日常生活、課業表現，甚至生長發育。本科提供口服中藥如傳統水煎劑、濃縮中藥粉或中藥膏方。有些兒童對藥物治療的接受度低，為此本科另提供藥物之外的治療方式，如雷射針灸、穴位推拿、穴位敷貼、捏脊療法、護眼顧鼻操以及中醫飲食衛教，陪孩子與爸媽一起戰勝過敏性鼻炎！
本科設有「中醫小兒氣喘加強照護門診」，針對年齡12歲以下氣喘患童，除了口服中藥，並搭配針灸、穴位推拿、穴位敷貼、氣霧吸入、中醫衛教與中醫診斷儀器輔助評估。中醫兒科和兒童醫院兒童胸腔科、兒童過敏免疫風濕科進行中西醫整合照護，提供過敏原檢測、肺功能檢查等檢查項目，讓孩童接受更完整的治療與評估以監測氣喘控制程度。研究也顯示接受氣喘加強照護治療的患童，能協助氣喘的控制，並改善氣喘兒與家長的生活品質。
妥瑞症與大腦的神經迴路異常有關，多在幼年發病，有時伴隨過動症、強迫症等。臨床發現妥瑞兒合併鼻過敏症狀有近九成，若及早治療兩者皆可獲得有效改善。
本科黃正豪醫師使用中藥及針灸，雙管齊下，症狀即能獲得有效改善；針對排斥服用中藥的小兒，臨床採以頭皮針為主，黃醫師透過特殊手法及多年經驗，使小兒不畏懼針灸並取得療效。黃醫師也特別成立臉書「妥瑞症中醫交流平台」，提供衛教諮詢，與妥瑞兒及家屬共同戰勝惱人的病症！
范芝瑜醫師針對兒童癌症患者化療過程中的副作用進行觀察與研究，發現兒癌小朋友體質屬「虛實夾雜」，治療過程中易出現血球降低及疲倦的表現，若貿然使用中藥的補藥，對癌症治療仍有未知的風險。故范醫師以化療不同階段分期的想法，使用中藥「攻補兼施」調整體質，加上「和解疏泄」的概念，讓化療藥物能達到最佳的治療效果，並能緩解化療過程中的副作用，對於虛弱體質可適當使用中藥增進體力，將化療藥物導致身體的不適降到最低。
流行病學統計，約1/5已開發國家人口受異位性皮膚炎所擾。異位性皮膚炎是過敏三部曲之第一部曲，提升日後對罹患氣喘、過敏性鼻炎之機率。其最大特色是反覆搔癢，越抓越癢形成惡性循環；皮膚屏障不佳易受刺激而誘發不適。為改善異位性皮膚炎，本科治療特色為中藥藥浴，年紀較大兒童可搭配口服中藥，並針對各種皮膚病灶型態設計多種外用藥膏。指導日常生活正確觀念，加強保濕、避免外來刺激等，協助患童早日免於異位性皮膚炎之侵擾。
現代醫療進步，除了孩子健康，父母也期望長得好！若太瘦，太矮，或長得太慢、太快都讓父母憂心！透過身高、體重及性徵發育的觀察，可及早發現生長發育的潛在問題，即時治療對身高與發育可獲得改善。中醫藥須在正確時機使用，避免揠苗助長。本科有該領域的豐富臨床經驗與研究，並有受過西醫兒童生長發育訓練之中醫師，提供合適的中醫藥治療如口服中藥、外用敷臍、穴位按摩、雷射針灸與中西醫衛教，協助父母解決寶貝的生長發育問題。
